Logée dans une ancienne carrière de la colline de Chaillot, face à la Tour Eiffel, la partie architecturale émergente de l’Aquarium est conçue pour s’intégrer au site en se fondant au paysage des jardins du Trocadéro.
On y trouve 15.000 poissons de 500 espèces différentes dont des murènes, hippocampes, poissons-clowns, rascasses, mérous, poissons-pierres, mais aussi des espèces spectaculaires comme les requins et les raies. Les poissons seront répartis dans 43 bassins , dont le plus grand fait 33 mètres de long sur 10 mètres de profondeur. Le remplissage des bassins a nécessité 4 millions de litres d’eau.
L'accès par un tunnel immergé simule une promenade sous la mer. Un espace à l'entrée de l'aquarium est réservé à la faune d'eau douce d'Ile-de-France. Le reste des bassins est consacré aux poissons des mers froides et chaudes.